Az intézetben több kutatócsoport működik, melyek saját anyagi forrásokkal is rendelkeznek. Aktív kutatómunka folyik az alapkutatás, klinikai kutatás és a transzlációs kutatás terén az alábbi területeken:
vascularis biológiai kutatócsoport: az érbetegségek, az oxigén és a komplexált vas kapcsolata- koraszülöttek érbetegségeinek mechanizmusa, az oxigéntoxicitás és érbetegségek kapcsolata
a hematológia-onkológia (ALL-AML vizsgálata)
a gyulladásos tüdőbetegségek pathogenezisének sejtszintű vizsgálata